Corría el año 1870 cuando el jesuita P. Agustín Cabré SJ llegó a Valencia con el objetivo de fundar un colegio de la Compañía de Jesús. La iniciativa, respaldada a su vez por el también jesuita P. Severo Ochoa SJ, se encargó entre 1879 y 1880 al arquitecto José Quinzá Gómez quien construyó el Colegio San José en un solar actualmente ubicado en la Gran Vía Fernando el Católico. Dicho solar fue adquirido al Barón de Benidoleig en 1879. Ese mismo año, más concretamente el 4 de junio, tuvo lugar la colocación de la primera piedra.
En 1881, cuando aún estaban por realizar el salón de actos y la iglesia, falleció José Quinzá y asumió el encargo el arquitecto Joaquín Mª Belda Ibáñez. Belda dio por finalizado el salón de actos a principios del año 1884 mientras que la iglesia fue consagrada el 12 de octubre de 1887.